Año 70 de la Era Cósmica, la guerra entre la Alianza Terrestre y ZAFT, cuyo detonante fue la tragedia del "San Valentín Sangriento", se vuelve más y más cruenta. Tras muchos sacrificios, se consigue una tregua después de la segunda batalla en Yakin Due. Sin embargo, esta tregua no soluciona los conflictos entre los Naturales y Coordinadores.
Durante la guerra, Shinn Asuka se vió envuelto en la invasión de la Alianza Terrestre en Orb. Cuando estaba escapando de la batalla, perdió a sus padres y a su hermana justo delante de sus ojos.
Cuando se encontraba en un momento de profundo dolor aferrado al teléfono móvil de su hermana, su único recuerdo de ella, un Gundam volaba sobre su cabeza.
Tras semejante pérdida, abandonó Orb y se dirigió hacia Plant.
En el año 73 de la Era Cósmica, Shinn se volvió un soldado de ZAFT.