Hitomi Kanzaki es una típica chica de instituto, con todos los problemas normales de un instituto. Pero cuando una visión de un joven peleando con un dragón se hace realidad, su vida cambia para siempre. Entra en una dimensión junto al joven guerrero, Van, Hitomi es introducida dentro del extraño mundo de Gaia.
Van debe aprender a ser un maestro en el uso de su arma, Escaflowne. Perseguidos por el Imperio de Zaibach, Van e Hitomi encontraran aliados y enemigos en un esfuerzo por descubrir los secretos de Escaflowne