Esta tercera temporada de Mahou Shoujo Lyrical Nanoha tiene lugar después del epílogo de Mahou Shoujo Lyrical Nanoha A's.
Mientras que el epílogo conecta A's al mundo de seis años más tarde, StrikerS avanza en la cronología otros 4 años, donde los personajes principales se han ido a trabajar a la Oficina de Administración de Tiempo y Espacio (TSAB).
La serie se centra más en las batallas de equipo y la burocracia más que en la rivalidad individual y la vida escolar, debido al cambio en las dinámicas de los personajes.