Basado en el manga Koukaku Kidoutai (Ghost in the shell) de Shirow Masamune.
En el año 2027, año siguiente al fin de la IV Guerra Mundial no nuclear. Una bomba estalla en la ciudad de Newport City, matando a un importante distribuidor de armas que podría tener lazos con la misteriosa Organización 501. El oficial de seguridad pública Daisuke Aramaki contrata a la cyborg Motoko Kusanagi para investigar el caso, en el mismo están Batou (quien cree que Kusanagi es una criminal), el detective Togusa de la prefectura de Niihama (que está investigando un caso de asesinato en serie de prostitutas, que cree que está relacionado con este caso) y el teniente coronel Kurtz de la Organización 501 (quien también quiere mantener un ojo en Kusanagi)
Una parte recurrente de las OVA's será el misterioso virus de ordenador "Fire Starter", así como las vidas de Batou y Togusa antes de la formación de la Sección 9.
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