Bubblegum Crash! tiene lugar un año después de que la Crisis comenzara. GENOM parece tranquilo por el momento, pero una nueva ola de crímenes Boomer provoca que los Knight Sabers resurjan tras un período de inactividad. ¿Quién será la voz misteriosa que se esconde tras los numerosos robos de los componentes de un avanzado sistema de inteligencia artificial?