Invitado a una celebración de aniversario, Kindaichi, Miyuki y el inspector Kenmochi visitan de nuevo la Ópera. Allí ellos descubren que la obra " El Fantasma de la Ópera " está siendo ensayada otra vez. Sin embargo, esto no dura mucho tiempo ya que los miembros de la compañía son asesinados por "el Fantasma". Kindaichi otra vez tendrá que solucionar una serie de asesinatos en la Ópera.
Se trata de un especial que conmemora el décimo aniversario del inicio de la serie de animación.