Myself ; Yourself es una historia que tiene lugar en el año 2007, concretamente en la ciudad ficticia japonesa de Sakuranomori, situada en el borde de la prefactura y abierta al Oceano Pacífico. Sakuranomori es la ciudad natal de Sana Hidaka, un estudiante de dieciséis años que creció junto a su amiga de la infancia Nanaka Yatsuhiro, su prima Aoi Oribe, y su mejor amigo Sysuke Wakatsuki y su respectiva hermana gemela Syuri Wakatsuki.
Debido al trabajo de sus padres, Hidaka se ve obligado a mudarse a Tokio con ellos. Cinco años más tarde, Hidaka -ya estudiante de Secundaria- decide volver a Sakuranomori. Sin embargo, las cosas no parecen ser lo que eran antes- la que parece estar más cambiada es su amiga de la infancia Yatsuhiro Nanaka, que, por alguna razón, parece haber adoptado una personalidad fría y triste.
En definitiva, la serie es una conmovedora historia de amor entre un chico y una chica que crecieron juntos y tienen que soportar la separación que ha habido durante todo ese tiempo, divididos entre los buenos recuerdos y la cruda realidad que ahora deben afrontar.